Название переулка дано по находившейся здесь в ХVII веке Патриаршей слободе. В 1932 году после переименования Патриарших прудов в Пионерские переулок также получил новое название - Малый Пионерский. Историческое название было возвращено в 1990 году. По четной стороне переулка находится Патриарший пруд (по традиции употребляется название во множественном числе)